Komputer to nie jest bezpieczne środowisko do podpisu elektronicznego. Na
przykład koń trojański może tuż przed podpisaniem dokumentu zmienić jego
treść albo przechwytując polecenie podstawić do podpisu inny dokument i
dopiero wtedy przesłać go do czytnika smart card. Najlepiej by było żeby
podpis był robiony na wydzielonym minikomputerze, żeby można było na nim
wyświetlić treść podpisywanego pliku i ten komputer byłby zabezpieczony
przez przesyłaniem innych plików niż te do podpisania.